Agroscope è attiva nelle seguenti sedi:
campus di ricerca centrale di Posieux;
centri di ricerca regionali di Changins e Reckenholz;
stazioni sperimentali decentrate.
Il campus di ricerca centrale è la sede principale del Consiglio di direzione e il centro per le infrastrutture di laboratorio e la tecnologia di ricerca. È competente per i seguenti settori:
animali;
derrate alimentari e alimentazione;
agroeconomia.
I centri di ricerca regionali sono competenti per i seguenti settori:
selezione vegetale e sviluppo di varietà;
agroecologia e risorse naturali;
protezione dei vegetali;
sistemi di coltivazione per le colture campicole.
Le stazioni sperimentali decentrate sono competenti per la ricerca orientata all’applicazione e alla pratica nel rispettivo contesto regionale e climatico. Collaborano con servizi cantonali, associazioni di categoria nonché istituzioni di ricerca e di consulenza. Possono essere istituite a tempo determinato.
Il direttore dell’Ufficio federale dell’agricoltura (UFAG) assume la guida strategica di Agroscope.
L’UFAG emana un regolamento interno che disciplina la conduzione, l’organizzazione, i compiti e le competenze di Agroscope.